Biyolojik açıdan ekosistem üzerinde madde döngüleri 1- Azot, 2- Karbon, 3- Oksijen, 4- Su olarak gruplandırılır. Bu döngüleri açıklayacak olursak

1-) AZOT DÖNGÜSÜ : Canlılar için hayati önem taşıyan aminoasit, nükleikasit, vitamin ve hormon gibi moleküllerin yapısına katılması bakımından azot oldukça önemli bir fonksiyona sahiptir. Bitkilerinde bu azotu kullanabilmesi için nitrat tuzuna çevrilmesi gerekir. Bu işlemide baklagillerin köklerindeki bakteriler yapmaktadırlar. Döngüyü şematize edicek olursak ;
ATMOSFER --------> AZOT BAĞLAYICI BAKTERİLER ----------> YILDIRIM VE ŞİMŞEK ------> Nitrat Tuzuna Dönüştürülüyor ---(((üretici>Tüketici ))) --------->>> Azot Tuzuna Dönüşüm Sonrası yine Atmosfere karışarak döngü sağlanıyor.
2-) Karbon Döngüsü : Canlılardaki organik moleküllerin yapı taşlarıdır ve kaynağını atmosfer oluşturur.
Atmosfer---------- Fotosentez >> Üreticiler-- Tüketiciler = Ölüm ------Saprofitler ve sonrasında yine atmosfere karışır.
3-) Oksijen Döngüsü : Ökaryot canlıların enerji üretmesi için lazımdır. Ã?zellikle yanma ve solunum olayında kullanılır.
Döngüsü : Fotosentez ----- Oksijen (O2) ------- Solunum -------- H2 + CO2
4-) Su Döngüsü :
Yağış --- DEniz--- Buharlaşma ----Havadaki Su buharı --- Toprak>Bitki> terleme>Buharlaşma--- Göl <----- Yağış